أصدر وزير العدل والشؤون الاسلامية والأوقاف الشيخ خالد بن علي بن عبدالله آل خليفة قرار رقم (6) لسنة 2011 بشأن نظام صرف المكافآت الثابتة والمقطوعة للعاملين بمركز احمد الفاتح الاسلامي. وجاء في القرار انه وبعد الاطلاع على المرسوم الملكي رقم (59) لسنة 2010 بتشكيل الوزارة وبناءً على عرض وكيل الوزارة للشؤون الاسلامية، فقد قرر الآتي (المادة الأولى: تحدد المكافأة الثابتة الشهرية والمكافأة المقطوعة السنوية للعاملين بمركز احمد الفاتح الاسلامي وفقاً للجداول المرافقة لهذا القرار، المادة الثانية: يشترط لصرف مكافأة ثابتة شهرية للعاملين بالمركز بدوام جزئي ان لا تقل عدد ايام اعمالهم عن خمسة عشر يوماً شهرياً، المادة الثالثة: على رئيس المركز الاحتفاظ بالسجلات اللازمة لضبط حضور العاملين بالمركز، وبيان ايام غياب من يتغيب دون عذر مقبول وإجراء الخصم المناسب من المكافأة وفقاً لعدد ايام الغياب والمادة الرابعة فعلى وكيل الوزارة للشؤون الاسلامية تنفيذ هذا القرار، والعمل به اعتباراً من اليوم التالي لتاريخ نشره في الجريدة الرسمية. وبيّن القرار بأن المكافآت المخصصة لدار القرآن الكريم تم تقسيمها الى مكافآت ثابتة شهرياً ومكافآت مقطوعة سنوياً، ويبلغ اجمالي المكافآت الثابتة سنوياً لدار القرآن الكريم 83160 ألف دينار، وإجمالي المكافآت المقطوعة السنوية 12 ألف و500 دينار. وأما قسم الدعوة والارشاد فقد بلغ اجمالي المكافآت الثابتة سنوياً للمسجد 27 الف دينار والمكافآت المقطوعة 24 الف و500 دينار، وقسم الزيارات فالمكافآت الثابتة بلغت 63 الف و600 دينار والمكافآت المقطوعة 6 الاف دينار. وأشار القرار الى المكافآت التي حددت للمكتبة فكانت 10 آلاف و800 للثابتة، و22 الف ومائتي دينار اجمالي المكافآت الثابتة للمستخدمين.